El nuevo equipo debutaría en la temporada 2007-08, tomando la plaza del ya extinto FC Superfund, y se quedó en un noveno lugar, salvando la categoría.
Actualmente lucha por mantenerse en la Bundesliga y consolidarse como club de referencia del fútbol austriaco.
El 14 de junio de 2010, tanto el club como su filial al 100% SK Austria Kelag Kärnten Wirtschaftsbetriebe GmbH , que se encargaba de comercializar los espacios publicitarios, los jugadores y la publicidad perimetral, se declararon en quiebra.
El SK Austria Kärnten jugaba sus partidos como local en el Hypo-Arena, conocido también como Wörtheseestadion, con capacidad para 12.500 personas y césped natural.
Este estadio es una de las sedes de la Eurocopa 2008 que se celebrará en Austria y Suiza, y durante el evento contará con una capacidad superior, 30.000 personas.