Fue fundado en el año 1986 en la ciudad de Kartileh, aunque sus partidos de local los juega en la capital Yibuti y cuenta con una sección de fútbol femenil.

Es un de los equipos fundadores de la Primera División de Yibuti[1]​ y había desaparecido temporalmente en el 2001, pero fue refundado un año más tarde.

Ha sido campeón de la Primera División de Yibuti en 2 ocasiones y han ganado 1 título de copa y dos supercopas.

A nivel internacional han participado en 2 ocasiones en la Liga de Campeones Árabe, pero en ambos casos no pasaron de la primera ronda.

La principal rivalidad del SID Kartileh es con el otro equipo de la ciudad, en Kartileh FC.