Su padre, Grigori Ivánovich Skrýnnikov, trabajaba como ingeniero en la central hidroeléctrica de la ciudad sobre el río Rioni.
En 1953 se doctoró en la Universidad Estatal de Pedagogía Herzen, defendiendo la tesis Desarrollo económico de las fincas en Nóvgorod a finales del siglo XV e inicio del XVI.
En estos trabajos Skrýnnikov realizó una revisión completa del desarrollo político de Rusia en el siglo XVI y demostró que la opríchnina no era una unidad política con principios únicos.
Estas investigaciones se publicaron en las monografías Tsartsve terrora ("El reino del terror", 1992), Traguedii Novgoroda ("La tragedia de Nóvgorod", 1994), Krushenni tsartsva ("El naufragio del reino", 1995) y Velikom gosudare Ioanne Vasilieviche Groznom ("El gran soberano Ioann Vasílievich el Terrible", 1997, 2 tomos).
Sus principales campos de estudios fueron la opríchnina y el Período Tumultuoso, sobre el que escribió asimismo algunos libros, entre los cuales el más conocido es Tsar Borís i Dmitri Samozvanets ("El zar Borís y Dmitri I el Impostor", 1997).