Por su físico (1,86 metros) lo ponían en divisiones mayores a la que correspondía por su edad.El lujanino hizo pareja en la defensa con el "Tata" José Luis Brown y ese día también estuvieron en el equipo Russo, Trobbiani, Trama.[8] Agüero no recibió más convocatorias de Bilardo hasta que Carlos Pachamé lo llamó para integrar el equipo que participaría en los Juegos Olímpicos de Seúl 1988, en Corea del Sur.[9][10][11] De vuelta al fútbol argentino se quedó en Estudiantes hasta 1990 para completar 209 partidos y 14 goles.Se quedó y en el torneo 1991-1992 (jugó 29 encuentros), el granate fue campeón dirigido por un excompañero de Estudiantes: Miguel Ángel Russo.