Roko es hijo del exbaloncestista Nikola Prkačin, natural de Zagreb, es un jugador formado en la Cibona Zagreb.
En agosto de 2018, Cibona decidió ceder al jugador al KK Rudeš de la Segunda División.
En enero de 2019, regresaría al primer equipo para jugar en la A1 Liga, la primera categoría del baloncesto croata.
El 12 de enero de 2019, Prkačin hizo su debut profesional y en la Liga Adriática con el Cibona en la derrota por 89–68 ante el KK Cedevita, logrando 6 puntos y 6 rebotes.En 5 partidos de la Liga Adriática en la temporada 2018-19, Prkačin promedió 2,2 puntos, 2,0 rebotes y 0,4 asistencias por partido.
En septiembre de 2022 disputó con el combinado absoluto croata el EuroBasket 2022, finalizando en decimoprimera posición.