[1]​ Bauer llegó al FC Ingolstadt 04 en 2014 procedente del Karlsruher SC.

Bundesliga el 31 de octubre de 2014 ante el Fortuna Düsseldorf reemplazando a Alfredo Morales durante el entretiempo.

Anotó su primer gol en Bundesliga contra el SV Darmstadt 98 el 22 de noviembre de 2015.

Entre Alemania o Kazajistán, Bauer reveló que había rechazado una oferta de esta última en febrero de 2015, con la esperanza de representar a Alemania.

En 2016 fue convocado para disputar los Juegos Olímpicos de Río de Janeiro 2016 con la selección sub-23 de Alemania, consiguiendo la medalla de plata tras perder la final contra Brasil por penales.