Sin embargo, el candidato opositor Sergei Bagapsh alcanzó más votos el día de las elecciones, que ampliamente se atribuyó a un espaldarazo contra la fuerte influencia rusa en la campaña.Después de las elecciones, tanto Bagapsh como Jadyimba reclamaron la victoria, con Jadyimba alegando fraude electoral en el pro-Bagapsh distrito de Gali, que fue el que hizo ganar las elecciones a Bagapsh.Ardzinba pronto destituyó a Jadyimba como primer ministro, reemplazándolo por un candidato de compromiso, Nodar Khashba, siguiéndole dos meses de disputas, con manifestaciones públicas, procedimientos judiciales y procedimientos parlamentarios.Como parte del trato, el puesto de vicepresidente se le dio mayores atribuciones, incluyendo defensa y relaciones exteriores.Sin embargo, en las postrimerías de la victoria electoral, muchos analistas sugirieron que la autoridad ejecutiva de Jadyimba estaba limitada bajo el nuevo acuerdo, con Bagapsh y su primer ministro, Alexander Ankvab, mantenían la última palabra en los temas nominalmente asignados al vicepresidente.Un mes después, Jadyimba reiteró su postura contraria a la política exterior de Bagapsh, afirmando que solo Rusia podría proteger a Abjasia, y el uso de la fuerza era inevitable para tomar el control del alto Valle Kodori, zona al noreste de Abjasia bajo control georgiano.
