Radicándose en Barrancabermeja, Santander (Colombia) donde conoció a su esposa Aura Ramírez, militó en el movimiento sindical.
De esta ciudad también tuvo que migrar por su relación con el movimiento, cuando su seguridad personal fue amenazada nuevamente.
Huyó a Venezuela, en donde desarrolló su carrera musical y compuso muchas de sus obras.
La información sobre la vida personal de Rafael Godoy Lozano es escasa, pero su obra musical y especialmente su canción más importante es «Soy colombiano».
Volvió al país en viajes esporádicos durante el gobierno de Rojas Pinilla, viajes en los cuales conoció a Antonio Botero, fundador de la disquera Sonolux, y a Darío Garzón, del dueto Garzón y Collazos, con quienes empezó la producción musical.