Hijos de este matrimonio fueron: Rafael Calderón Guardia, presidente de la República de 1940 a 1944, casado en primeras nupcias con Yvonne Clays Spoelders y en segundas con María del Rosario Fournier; María, casada en primeras nupcias con Luis Fernández Jiménez y en segundas con Samuel Piza Chamorro, cónsul general de Costa Rica en Nueva York de 1943 a 1948; y Francisco Calderón Guardia, casado en primeras nupcias con Leticia Gei Bernini, en segundas con Josefina González y en terceras con María Luisa López.

Fue médico de pueblo en Paraíso, y también ejerció su profesión en San José durante muchos años.

La Santa Sede le otorgó en 1934 la Cruz de San Gregorio el Grande.

Durante la administración constitucional de éste fue senador (1917-1919) y ministro plenipotenciario en misión especial en Honduras (1919).

En los comicios de 1940, en las que su hijo Rafael Calderón Guardia fue elegido presidente de la República, Rafael Calderón Muñoz fue elegido diputado por San José para el período 1940-1944, y el Congreso Constitucional lo nombró como primer designado a la presidencia para ese mismo cuatrienio.

Sin embargo, no ejerció funciones legislativas, ya que fue nombrado consejero honorario de Costa Rica en los Estados Unidos de América y se radicó en San Francisco, California.