El río discurre en dirección oeste en una región en la que predomina la taiga, con un curso muy sinuoso, lleno de meandros y en el que recibe multitud de pequeños arroyos y ríos por ambas márgenes a lo largo de todo su recorrido.
El río corre a través de una región poco habitada (con la aparición de gas natural y petróleo ahora mucho más poblada), con un clima bastante severo, de modo que en su curso no encuentra ningún centro urbano de importancia y solamente pequeños asentamientos, siendo los más importantes, aguas abajo, Boshói Panás, Larjak, Pug'iug, Labaz'yegan, Ojteur'ie, Lopchinskiie, Ust-Kolik'iegan, Kirikina, Pyliny, Bol'shetarjovo y Soromina.
En la parte final el río desemboca por la derecha en el río Obi, aguas abajo de Bylino y Kabino, y unos 20 km aguas arriba de Nizhnevártovsk (239.044 hab.
Al llegar la época estival, como se deshielan primero las zonas más al sur, el río inunda amplias zonas bajas próximas a sus riberas que convierte en terrenos pantanosos.
El Vaj es navegable en su curso inferior y medio, 432 km hasta Larjak, pero es poco utilizado.