El río San Pedro es un río amazónico boliviano, un afluente que forma parte del curso alto del río Grande.

El río discurre por el departamento de Potosí y departamento de Chuquisaca.

El río san Pedro nace en el departamento de Potosí, cerca de la población de San Pedro de Buena Vista, en la confluencia del río Sacani y el río Molinos, a una altitud de 2.546 m (18°15′59″S 66°00′08″O / -18.26639, -66.00222).

El río discurre en dirección sureste hasta recibir a uno de sus tributarios, el río Micani (18°20′51″S 65°51′33″O / -18.34750, -65.85917), y luego toma dirección noreste (hasta 18°17′21″S 65°48′47″O / -18.28917, -65.81306) donde vuelve a discurrir al sureste hasta recibir un nuevo afluente proveniente del sur, el río Chayanta (18°21′08″S 65°41′38″O / -18.35222, -65.69389).

Desde este punto el río San Pedro forma frontera entre los departamentos de Potosí y Chuquisaca, en un tramo de 48 km hasta su confluencia con el río Caine, donde pasa a formar definitivamente el río Grande o Guapay (18°25′3″S 65°20′43″O / -18.41750, -65.34528).