Es un afluente izquierdo del Danubio,[1]​[2]​al que se une cerca de Banatska Palanka.

Su parte más alta, aguas arriba de la confluencia con el Nerganița, se llama también Nergana.

En este tramo, el Nera recibe su afluente izquierdo, el Rudăria, y pasa junto a numerosas aldeas (Prilipeț, Dalboșeț, Moceriș), hasta llegar a Șopotu-Nou, donde gira bruscamente hacia el noroeste, todavía curvando alrededor de los montes Seménicos.

En el tramo fronterizo, el Nera fluye a través de la depresión de Bela Crkva (Belocrkvanska kotlina; cirílico: Белоцркванска котлина), y entre los asentamientos del lado rumano se encuentran Lescovița, Zlatița y Socol, mientras que en el lado serbio sólo hay un pueblo en el propio río, Kusić, con varios asentamientos en las inmediaciones del río: Kaluđerovo, la ciudad de Bela Crkva, Vračev Gaj y Banatska Palanka.

En Vračev Gaj, el río gira hacia el sur y desemboca en el Danubio cerca del pueblo de Stara Palanka.