El río Merkys (en el idioma bielorruso Мерычанка o Мяркіс (Merychyanka, Myarkis)) es un río que fluye por Lituania y Bielorrusia.

El Merkys desemboca en el río Neman en la localidad de Merkinė.

Los mayores afluentes de Merkys son: En las orillas del río es el ciudad lituano Varėna.

Sus ríos son claros y frescos.

Mucha parte de este región es protegida por el parque nacional Dzūkija.