Discurre el río inicialmente en dirección sensiblemente oeste, bañando al poco de nacer Astaná, la capital del país (llamada Akmola hasta 1998, con 600.200 hab.Recibe luego por la derecha los primeros de sus afluentes importantes, el río Koluton (de 200 a 240 km, según las fuentes), el Žabaj y el Terisakkam (~350 km).Cruza, en la misma dirección, la frontera rusa y se adentra en el óblast de Tiumén, bañando Kazankoe e Ishim (67.757 hab.La ciudad también está dividida en dos secciones, la derecha (norte) o el casco antiguo de la ciudad, y la izquierda (sur), donde están los nuevos edificios del gobierno, como el Ak Orda, la Casa de Gobierno, y la Corte Suprema de Justicia, así como muchos y prestigiosos complejos residenciales.Desde 1998, el río Ishim en Astaná ha sido acondicionado para evitar las inundaciones y mantener el nivel del agua, con el fin de proporcionar uso recreativo y garantizar la apariencia.La región se encuentra solo a 100 m sobre el nivel del mar.Estos ciclos causan cambios dinámicos en la salinidad y las comunidades vegetales.
El Ishim cerca de Derzhavinsk (Kazajistán) (1996)
Central hidroeléctrica en el Ishim, en Petropavlovskij (junio 2008)
