El río Bolshaya Jeta nace en unas modestas colinas del extremo norte de la llanura de Siberia Occidental, al norte del círculo polar ártico.
El río discurre primero en dirección sur, pero al poco describe una amplia curva y se encamina hacia el norte por una zona predominantemente llana y pantanosa, rica en lagos (más de 6000 en su cuenca).
Desemboca en el río Yeniséi por la izquierda, a pocos kilómetros de la desembocadura, ya en la golfo al que le da nombre, golfo del Yeniséi.
No hay vegetación, excepto musgos, líquenes y algunas hierbas.
Al llegar la época del deshielo, como se deshielan primero las zonas más al sur, el río inunda amplias zonas próximas a las riberas.