Está compuesto por unos cinco desoxirribonucleótidos (ADN) flanqueados por unos diez ribonucleótidos (ARN) a cada lado.
En la secuencia de ADN se encuentra la base que se desea cambiar en el ADN del individuo diana, mientras que la secuencia flanqueante aporta especificidad y estabilidad al híbrido.
En el núcleo celular el quimeroplasto reconoce la secuencia complementaria y se une a ella formando un híbrido.
El sistema de reparación de la célula localiza el desemparejamiento (mismatch) y lo corrige eliminando la base del genoma dianay sustituyéndola por la base complementaria a la secuencia del quimeroplasto.
Su eficacia, sin embargo, ha sido puesta en duda desde su surgimiento.