[1][2] Consiste en células flageladas similares a coanocitos fijadas en la superficie exterior de la matriz, que son las que mueven el agua utilizando los flagelos y generando corrientes de agua a través de las microvellosidades que atrapan alimento como bacterias y detritos,[3][4][5] mientras que en el interior de la matriz hay células ameboides que se dividen y hacen crecer la colonia.
Algunas células ameboides pueden ir transformándose en coanocitos a medida que la colonia crece.
Su morfología puede variar desde cadenas de células a conjuntos organizados.
[6] Proterospongia en sí mismo no es el antepasado de las esponjas.
Sin embargo, sirve como un modelo útil para entender como fueron los antepasados de las esponjas y otros metazoos.