La primera temporada se disputó en 1999, remplazando a la Central League y la Football Combination, como máxima competición de filiales.

Tottenham Hotspur decidió no formar parte de la Premier Reserve League 2009/10 y otros equipos hicieron lo mismo en las siguientes dos temporadas.

Al final de esa temporada, la liga fue sustituida por una competición sub-21, llamada Professional Development League.

La final de 2007, que tuvo lugar en el estadio Madejski , Reading venció a Bolton por 2-0.

En el final de la temporada 2011–12 celebrado en Old Trafford , el Manchester United Reserves venció a Aston Villa Reserves 3–1 en penales después de que el juego terminara 0–0 en tiempo normal.