[1][2][3] Shane, Tori y Dustin son tres estudiantes en la Academia Wind Ninja.
Su rendimiento es inferior al del resto de estudiantes, y eso les gana muchas riñas con su sensei.
Un día, Lothor, un maestro ninja expulsado, ataca la academia y captura a todos los estudiantes.
Al principio ambas facciones luchan entre sí, aunque acaban uniendo fuerzas y se les une un sexto Ranger.
Lothor también atacó su academia, y después les hizo creer que el ataque fue cosa del sensei de los Wind Rangers, y así buscan en un principio venganza contra ellos, hasta que descubrieron la verdad y se unieron a sus antiguos enemigos contra Lothor.