El objetivo es alinear a los Pokémon para debilitar al enemigo El objetivo es alinear Pokémon de la misma especie para que desaparezcan del área de juego y poder así superar las diferentes fases.
Para superar cada fase, se tendrá que reducir a cero los PS del Pokémon rival con un número determinado de turnos.
Si se completa un nivel y sobran turnos, estos ayudarán en aumentar el ratio de captura del Pokémon.
Existe además un botón para que la consola automáticamente seleccione los Pokémon recomendables a utilizar en esa fase.
No es hasta la mitad de esta área donde Amelia explica qué es el registro y cómo funciona.
El juego posee microtransacciones con el cual se usa dinero de verdad en la Nintendo eShop para facilitar las cosas en el juego, ya sea comprando mejor tipos de Poké Balls, tener más corazones sin esperar o similares.