Su contraparte en la consola Game Boy Color es Pokémon Puzzle Challenge.

Luego de que el Pokémon haya "gritado" dos veces gritará una tercera vez de una manera más agresiva, si se logra hacer un combo de más de 3 gritos seguidos, el grito del Pokémon sonará cada vez más metalizado, lo que hará que al oponente le caiga un bloque cada vez más grande.

Hay un cierto punto, en el que cuando el Pokémon grite 22 veces o más, el bloque se volverá "infinito" y al adversario (sea la CPU u otro jugador) le será imposible derrumbarla por completo.

Los distintos modos a seleccionar en el juego son: En cada enfrentamiento contra el Equipo Rocket el jugador se verá dentro de los escenarios de varias de las escenas del anime donde Ash y sus amigos enfrentaron o se cruzaron con el Equipo Rocket, llegando a realizar incluso batallas que nunca sucedieron como la de la película Pokémon 2000, en la que el Equipo Rocket disfrazados de vikingos llevan a Ash y a sus amigos a través del océano hasta la Isla de Mewtwo.

VS line time: Partida para 2 jugadores en la que cada jugador debe bajar los bloques hasta debajo de una línea que parpadea en blanco, el primer jugador en colocar su torre de bloques debajo de la línea gana.