Fue fundado en 1973 y jugaban en la North American Soccer League desde 1973 a 1976.

En 1973 ganaron el campeonato de la NASL por 2-0 ante Dallas Tornado.

El Philadelphia Atoms fue fundado en el año 1973 por Thomas McCloskey.

El equipo debutó en la North American Soccer League en dicho año el 5 de mayo ante Saint Louis Stars, que cayeron por 1:0 Hizo un buen año y terminó ganando el campeonato de la NASL ante Dallas Tornado por 2 a 0.

En 1976, el club desapareció y dos años después surgió el sucesor de Philadelphia Fury en 1978.