Esta especie fue descrita originalmente en el año 2017 por los herpetólogos Jesús Díaz Rodríguez, Marcelo Gehara, Rafael Márquez, Miguel Vences, Helena Gonçalves, Fernando Sequeira, Iñigo Martínez Solano y Miguel Tejedo.

[2]​ Etimológicamente el epíteto específico hespericus refiere a la mitología griega, en la cual las Hespérides (en griego antiguo Ἑσπερίδες) eran las mélides que cuidaban un maravilloso jardín situado en un lejano rincón del occidente, al que algunos ubicaban en la península ibérica, de donde es endémico este anfibio.

[2]​ Este anuro fue incluido en Pelodytes punctatus[3]​ y denominado de manera ya definida: “linaje C”.

[4]​ La especificidad de Pelodytes hespericus fue diagnosticada sobre la base de la concordancia entre marcadores mitocondriales y nucleares, sin embargo, su diferenciación morfológica y bioacústica es baja.

[2]​ Este anuro es un endemismo ibérico, siendo exclusivo del centro y este de España, en altitudes comprendidas desde el nivel marino hasta por lo menos 2000 m s. n. m. (en Sierra Seca, en la provincia de Granada).