Durante nueve años consecutivos estudió las epidemias que asolaban París y registró los resultados de sus investigaciones en sus Mémoirs publicadas por la Academia de Ciencias entre 1746 y 1754, ligando las epidemias con la temperatura del aire.
Desde entonces, pasó mucho tiempo en la corte, lo que le valió un apartamento en el Louvre y habitaciones en Versalles.
En 1742 Malouin describió, en una presentación a la Academia Real, un método de revestimiento del hierro mediante inmersión en zinc fundido (i.e.
Otras 18 500 estaban invertidos en la Compagnie des Indes; sus posesiones personales se valoraron en 3 275 libras.
También contribuyó con 75 artículos a la Encyclopédie Méthodique de Charles-Joseph Panckoucke.