Patito llegó a Independiente en el año 1995, donde permaneció 13 años jugando en las categorías inferiores.

Luego de un gran campeonato en esa categoría, pegó el salto definitivo a la Primera División del Club Atlético Independiente.

[3]​ Tras la venta de Daniel Montenegro, el mismo Américo Gallego dio a entender que Patricio sería quien debería llenar el hueco que dejó la partida del emblemático capitán, dejándole la camiseta número 10.

[4]​ El domingo 30 de agosto en la segunda fecha del Apertura 2009 convirtió el primer y segundo gol (y envió una asistencia a Leonel Nuñez) en Primera siendo la figura indiscutida del partido en la victoria de Independiente ante Atlético Tucumán por 4 a 2.

Más tarde fue el turno de Antonio Mohamed, con quien Patito consiguió sus mejores actuaciones y pudo consagrarse campeón por primera vez en su carrera: Independiente ganó la Copa Sudamericana 2010 y Patricio fue una de las figuras del equipo en el certamen.

[6]​ Una fecha después metió otro gol, a Colón, recibiendo un gran pase entrelíneas de Hernán Fredes, eludiendo a un defensa y disparando al palo más lejano del arquero, en ese partido salió lesionado y debió perderse las siguientes fechas.

[10]​[11]​[12]​[13]​ 0 En su último partido en Independiente marca un doblete por la fecha 19 del Clausura 2012 ante Tigre , el partido terminaría en empatado y así Independiente privaría a Club Atlético Tigre de salir por primera vez campeón de primera en su historia.

Lo comparan con Bochini por su exquisita técnica que lo llevaría al fúubol boliviano, portugués, australiano, malayo, siendo suplente en Brasil y Grecia.

[17]​ Luego de varios partidos alternando titularidad con suplencia, volvió al gol en la victoria 2-0 del Santos ante el Figueirense.

Sin embargo Patricio Rodríguez y Atlante FC no se pusieron de acuerdo en su contrato.