El parque se encuentra cerca del centro del Triángulo de Coral, proporcionando hábitat a 390 especies de coral[2]​ así como muchos peces, moluscos, reptiles y mamíferos marinos.

[3]​ Fue establecido como parque nacional en 1991 y está entre los primeros del sistema creciente de Indonesia de parques marinos.

Abarca una superficie de 890,65 km², 97% de los cuales son hábitat marino.

El 3% restante es terrestre, incluyendo las cinco islas de Bunaken, Manado Tua, Mantehage, Nain y Siladen.

La parte meridional del parque abarca parte de la costa de Tanjung Kelapa.