El nombre Pakasuchus proviene del suajili "paka" (gato) y el griego "suchus" (cocodrilo).

Su cuerpo, a diferencia del de otros crocodilomorfos, está menos acorazado.

Poseía menos osteodermos dorsales que sus parientes, y eran más pequeños.

Pakasuchus ocupaba un nicho ecológico equiparable al de un mamífero carnívoro pequeño, como un gato.

El cladograma siguiente es modificado de O’Connor et al., 2010: Uruguaysuchus Libycosuchus Malawisuchus Candidodon Mariliasuchus Pakasuchus Adamantinasuchus Simosuchus Notosuchus Chimaerasuchus Sphagesaurus Comahuesuchus Baurusuchus