El río crea la microrregión de Pčinja, cuyo centro es la sede municipal de Trgovište donde el Tripušnica se encuentra con el afluente izquierdo del Lesnička reka (cirílico: Лесничка река) desde el sur y continúa hacia el oeste bajo el nombre de Pčinja.
El pequeño pueblo y el monasterio de Prohor Pčinjski se encuentran en el valle.
Justo después de que el río pase junto al monasterio, tras 52 km de recorrido en Serbia, el Pčinja cruza la frontera con Macedonia del Norte.
Durante los 83 km restantes, el río se curva suavemente hacia el suroeste.
Pasa junto a los pueblos de Karlovce, Dragomance, Strnovac, Vojnik, Klečevce, Pčinja, Studena Bara, Gorno Konjare, Dolno Konjare y la pequeña ciudad de Katlanovo, con la vecina Katlanovska Banja, el balneario más popular del norte de Macedonia.