Nikolaj Markussen (1 de agosto de 1988, Helsinge, Dinamarca) es un jugador de balonmano danés que juega actualmente en el Team Tvis Holstebro.

En diciembre de 2009 se le concedió el premio al futuro talento de parte del periódico danés Frederiksborg Amts Avis.

El fichaje se cerró pero con la opción de cederlo a un equipo con el objetivo de repescarlo en la temporada 2011-2012.

[1]​ Ambas parte decidieron que Markussen se quedara cedido una temporada en el Nordsjælland, hasta marchar dirección a Madrid en el verano de 2011.

En septiembre de 2012, se perdió la Supercopa de España contra el FC Barcelona Intersport, que perdió el Atlético por 31-34,[2]​ debido a un quiste de la rodilla del que fue operado en el mismo mes, y que lo tendría alejado de 2 a 3 semanas de las pistas.