Esta colección más tarde formó parte del Museo de Historia Natural de Hamburgo, y en 1867 estuvo abierto al público como "Die Ethnographische oder Sammlung für Völkerkunde im Anschluss un das Naturhistorische Museum in Hamburgo".
La colección, que en aquel tiempo poseía 645 objetos, tuvo por comisarios a Adolph Oberdörfer y Ferdinand Worlée.
Al principio, el empresario Carl W. Lüders dirigió el museo hasta 1896.
Georg Thilenius apoyó erigir un edificio del museo para albergar la colección.
Una vez aprobado, la construcción duró entre 1908 y 1912, con una ampliación para albergar una zona de trabajo completada en 1929.