El municipio de Jefferson (en inglés: Jefferson Township) es un municipio ubicado en el condado de McCook en el estado estadounidense de Dakota del Sur.

En el año 2010 tenía una población de 92 habitantes y una densidad poblacional de 0,99 personas por km².

[2]​ El municipio de Jefferson se encuentra ubicado en las coordenadas 43°38′8″N 97°32′12″O / 43.63556, -97.53667.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, el municipio tiene una superficie total de 92.62 km², de la cual 91,8 km² corresponden a tierra firme y (0,88 %) 0,82 km² es agua.

Del total de la población el 1,09 % eran hispanos o latinos de cualquier raza.