El municipio de Isle Harbor (en inglés: Isle Harbor Township) es un municipio ubicado en el condado de Mille Lacs en el estado estadounidense de Minnesota.

En el año 2010 tenía una población de 593 habitantes y una densidad poblacional de 7,13 personas por km².

[2]​ El municipio de Isle Harbor se encuentra ubicado en las coordenadas 46°6′42″N 93°29′55″O / 46.11167, -93.49861.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, el municipio tiene una superficie total de 83.2 km², de la cual 70,12 km² corresponden a tierra firme y (15,72 %) 13,07 km² es agua.

[3]​ Según el censo de 2010,[4]​ había 593 personas residiendo en el municipio de Isle Harbor.