La capital del municipio es la localidad de Villa Unificada Caserío Nueve.

Según el último censo boliviano de 2012 realizado por el Instituto Nacional de Estadística de Bolivia (INE), el municipio cuenta con una población de 11 194 habitantes y está situado a una altitud promedio de 1300 metros sobre el nivel del mar.

Su capital es Villa Unificada de la Comunidad Caserío Nueve y su territorio formaba parte del municipio (y provincia) de Caranavi.

Está formado por 160 comunidades de las que 12 son poblaciones urbanas y el resto son comunidades, cooperativas y colonias.

Desde 1992, la población del municipio de Alto Beni ha aumentado en un 37,2 %.