Kikoyu hizo las paces con el emperador, y Mononobe, preocupado de que pudiera estar implicado de alguna manera, donó a la corona dos aldeas bajo su jurisdicción.

[2]​ Mononobe y su contraparte Ōtomo no Kanamura estaban fuertemente en contra de la introducción del budismo en Japón, y discutieron ferozmente en contra de ello.

[3]​ Cuando el Rey Seong de Baekje envió regalos de sutras y estatuas budistas al Emperador Kinmei en 552, el emperador se enfrentó a un dilema político.

Para evitar ofender al Rey Seong o sancionar oficialmente el budismo, dio estos regalos a Soga no Iname, jefe del clan Soga y defensor de la nueva religión.

Mononobe fue un oponente político de Soga no Iname, y solicitó con éxito al emperador que impusiera un fallo contra la fe budista; entonces hizo que quemaran el templo del clan Soga y destruyeran la estatuilla budista.