En 1860, fue nombrado preparador de física después de recibir su Bachelor of Science por la Facultad de Besançon.
Subsecuentemente, en 1862, el grado en física, el de matemática en 1865, y de medicina, en 1873.
En 1884, obtuvo su doctorado en ciencias con una tesis sobre la estructura del estómago en crustáceos, luego trabajó como asistente en el Departamento de ictiología y de herpetología en el museo.
[1] Durante su carrera, describió numerosos taxones herpetológicos, notablemente especies de Madagascar, Tonkin, Borneo, México, Centroamérica.
[2] La abreviatura Mocquard se emplea para indicar a François Mocquard como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.