En 1953, el gobierno federal creó el Ministerio de la Salud y quita del Ministerio de la Educación y Salude las responsabilidades de administración destinadas a ella.
Curiosamente la sigla MEC continúa, sin embargo pasa a llamarse Ministerio de la Educación - como es conocido hasta hoy.
En 8 de noviembre de 1990, las actividades del MEC pasaron a integrar la política nacional de educación; la educación, enseñanza civil, investigación y extensión universitarias; el magistério y la educación especial.
Anexo:Ministros de Educación de Brasil El 12 de junio de 2000, después de muchos cambios en su estructura organizativa y la creación de secretarías como el Instituto Nacional de Estudios e Investigaciones Educacionales Anísio Teixeira (INEP) y el Fondo Nacional de Desarrollo de la Educación (FNDE), el MEC pasa a tener las siguientes competencias: política nacional de educación; educación infantil; educación en general, comprendiendo enseñanza fundamental, enseñanza media, enseñanza superior, enseñanza de jóvenes y adultos, educación profesional, educación especial y educación la distancia, excepto enseñanza militar; evaluación, información e investigación educacional; investigación y extensión universitaria; y magistério.
Este establece como áreas de cualificación del MEC las siguientes: Entre algunas áreas conectadas al Ministerio de la Educación se pueden citar: Entre las secretarías del órgano, están: