Anteriormente la actividad del ministerio se realizaba por las agencias estatales, como Comité Observador de ecología y utilización de los recursos naturales, Comité estatal de geología y recursos minerales,Comité estatal de hidrometeorología.
Para eso en Ministerio fue establecido el Departamento de promoción ecológica.
[4] En julio de 2004 fue firmado el acuerdo sobre la cooperación con la Turquía y Uzbekistán, en agosto del mismo año - con República Islámica de Irán.
Un mes después, el 13 de noviembre fue firmado acuerdo analógico con Fondo Mundial para la Naturaleza.
En 2007 el acuerdo sobre la cooperación fue firmado con la República de Moldova.