Debido a la inusual configuración geográfica de la ciudad asentada en 45 km de norte a sur, pero apenas 5 km en su parte más ancha, el problema del transporte público en Quito se fue agudizando sobre todo en las últimas décadas del siglo XX, al punto de ser considerado como inviable.

Lo curioso de esta propuesta es las "rectitud" del trazado, al menos desde lo que antes era el aeropuerto hasta el Centro Histórico.

[10]​ Entre estas se encontraba justamente un sistema de transporte ferroviario metropolitano (metro), que debido a la forma alargada de la mancha urbana era la opción avalada por expertos de Francia (París) y España (Madrid), con quienes Pérez conversó ampliamente, aunque no se llegó a concretar la obra durante su administración.

El Trole de Quito se inauguró en 1995 en la Alcaldía de Jamil Mahuad, la red planificada nunca se terminó, si bien se crearon corredores exclusivos BRT, estos funcionan a diésel, cuando el plan proyectaba que todos los buses debían ser eléctricos.

No obstante, el Trole (principal corredor del sistema) ya se hallaba colapsado para entonces, puesto que fue planificado para abastecer la demanda hasta el año 2010, y movilizar hasta 180 mil pasajeros, aunque para esa misma década transportaba más de 200 mil personas.

Con la llegada Barrera a la Alcaldía el proyecto del TRAQ fue desechado por completo, y se inició el plan de construir un subterráneo.

Por otro lado, registrándose en la página web del Metro se puede crear la llamada "Cuenta Ciudad" que permite recargar saldo y generar el código QR de ingreso mediante la página web o la aplicación del Metro.

[14]​[15]​ El trazado de la línea 1 contempla un recorrido de 22 kilómetros totalmente subterráneos, con estaciones ubicadas entre 1.000 y 1.800 metros, mientras que el túnel esta a profundidades entre los 8.26 y 22.92 metros.

[16]​ Para la construcción del túnel se previeron inicialmente tres métodos; el primero llamado entre pantallas o cut and cover, con el que se construirá alrededor de 1.8 km; el método convencional con algo más de 2 km, que cruzaría el Centro Histórico; y el método de tuneladoras, con una iniciando la excavación en la parte norte y otra desde el sur, para un total de 16 km.

[18]​ La construcción de las 15 estaciones está basada en el primer método mencionado (cut and cover), este método comprende cuatro etapas,[19]​ la construcción de un Muro Pantalla en el perímetro de la estación, posteriormente, sobre estas pantallas se funde una losa, que será el techo de la estación, con esto concluye el trabajo en la superficie, dejándola habilitada para el uso urbano, en la tercera etapa se remueve toda la tierra del interior vaciando la estación, y finalmente se procede a la adecuación de espacios interiores para las boleterías, vestíbulos, ascensores y colocación del andén.

[21]​ Durante todo el 2011 se realizaron estudios de factibilidad integral del proyecto (demanda y movilidad, viabilidad comercial, técnica, social, financiera e institucional), estudios de impacto ambiental.

[22]​ para el Metro que confirmaron que sí es posible construirlo, dado que la ciudad se compone en su mayoría de suelos blandos y compactos y tan solo el 1% del trayecto del metro presenta suelos duros (roca volcánica a la altura del panecillo).

En total se fabricaron 98.000 dovelas para formar 14.000 anillos de 8,43 metros de alto que recubrieron todo el túnel del metro desde Quitumbe hasta El Labrador.

[43]​ Los restos arqueológicos encontrados fueron destinados a una exhibición permanente dentro de la misma estación.

[45]​ Mientras tanto en el sur de Quito la tercera tuneladora "La Carolina" comenzaba a perforar el túnel en desde Quitumbe,[46]​ y su hermana "Luz de América" continuaba trabajando y acercándose lentamente centro histórico, pero en la superficie los ciudadanos estaban preocupados por la magnitud de la obra y que esta pueda afectar esta zona catalogada por la UNESCO como Patrimonio Cultural de la Humanidad.

[50]​ Entre tanto la Tuneladora "La Guaragua" se encontraba en mantenimiento en la estación de la Universidad Central del Ecuador tras completar el 73,3% de su recorrido previsto y en los siguientes días continuaría avanzando hasta la estación "La Alameda" y la última Tuneladora "La Carolina" ya había concluido su trabajo un mes atrás,[49]​[51]​ sumando un total de 14,6km del túnel y completando hasta ese momento un 68% de la obra total.

[64]​[65]​ Y en los días siguientes se continuaron realizando pruebas con pasajeros.

[43]​ los restos arqueológicos serán expuestos de forma permanente en la estación del metro en San Francisco, para que los ciudadanos nacionales y extranjeros puedan conocer el pasado colonial de la ciudad mientras desarrollan su trayecto cotidiano.

[44]​ En abril de 2021, la Fiscalía española presentó a la Audiencia Nacional una acusación por corrupción contra Consorcio GMQ, que se hizo adjudicar una contratación superior a $15 millones para estudios sobre la ejecución de la obra civil.

[70]​ En julio de 2016 se informó que los trenes a utilizarse en el Metro de Quito estarían compuestos por seis coches para una longitud total de 110 m, con 144 asientos, amplios pasillos y Wi-Fi gratuito, y que podrían acoger hasta 1500 pasajeros, el modelo sería el MQ117;[71]​ es decir el equivalente a diez unidades del sistema Trolebús.

[77]​ Sin embargo, se desató otra polémica cuando la empresa Marmot señaló que el logotipo era similar (aunque no igual) al escogido por la alcaldía.

Tras esto el municipio borró las imágenes y aseguró que se había tratado de una prueba.