McCool Junction es una villa ubicada en el condado de York en el estado estadounidense de Nebraska.

[3]​ McCool Junction se encuentra ubicada en las coordenadas 40°44′38″N 97°36′3″O / 40.74389, -97.60083.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, McCool Junction tiene una superficie total de 1.22 km², de la cual 1.21 km² corresponden a tierra firme y (0.85%) 0.01 km² es agua.

[4]​ Según el censo de 2010,[5]​ había 409 personas residiendo en McCool Junction.

De los 409 habitantes, McCool Junction estaba compuesto por el 96.09% blancos, el 0.98% eran afroamericanos, el 0.73% eran amerindios, el 0% eran asiáticos, el 0.73% eran isleños del Pacífico, el 1.22% eran de otras razas y el 0.24% pertenecían a dos o más razas.