Es hijo del exfutbolista de Rosario Central, Aldo Pedro Poy.

Se inició futbolísticamente en Rosario Central y debutó en primera división el 6 de marzo de 2002 en la derrota ante Racing por el Torneo Clausura 2002.

En el 2004 pasó a Club Atlético Racing, donde jugó la temporada 2004-2005 de la Primera B Nacional.

Luego pasó a Club Deportivo Godoy Cruz Antonio Tomba donde fue campeón del Apertura 2005 y logró el posterior ascenso a la primera división del fútbol argentino en 2006.

Después de una buena temporada en Godoy Cruz y a pesar del descenso a la segunda categoría, Mauro Poy fue transferido a Skoda Xanthi FC de Grecia en donde se desempeñó hasta mediados del 2012.