En 1626 obtuvo la ciudadanía de Fráncfort y se instaló como editor independiente.

En 1627 acepta como aprendiz a Wenzel Hollar, que será posteriormente famoso también como grabador.

En 1646, tras la muerte de su primera esposa un año antes, se casa con Johanna Sibylla Heim.

Matthäus Merian pasó una gran parte de su vida profesional en Fráncfort.

En colaboración con Martin Zeiler, un geógrafo alemán, y más tarde con su propio hijo, Matthäus Merian, el Joven (der Jüngere), edita una serie sobre topografía en 21 volúmenes llamada Topographia Germaniae.