En 1994, Wallner entró por primera vez en contacto con la política cuando se convirtió formalmente en miembro del Partido Popular Austriaco y fue empleado en la oficina provincial del Partido Popular de Vorarlberg en Bregenz.
El 13 de diciembre de 2006, Wallner fue nombrado como reemplazo del renunciante Hans-Peter Bischof en el gobierno provincial como vicegobernador, por lo tanto, Wallner asumió como Vicegobernador.
[2] Como tal, su área de responsabilidad abarcaba en el gobierno estatal de Vorarlberg los campos de derecho de salud y seguridad social, asuntos médicos, asistencia a discapacitados y, desde 2009, construcción, industria de la construcción, ingeniería mecánica e ingeniería eléctrica, así como teleféricos y tecnología de ascensores.
Hasta 2009 también fue responsable de cultura, educación, archivos y bibliotecas, y escuelas de música, pero la responsabilidad pasó a Andrea Kaufmann.
El cargo lo ejerce como vicegobernador en el gobierno estatal actual, junto a su colega de partido Karlheinz Rüdisser.