La serie limitada Kingdom Come, dibujada por Alex Ross y publicada en 1996, es quizás su obra más reconocida.

[2]​ Comenzó su trabajo profesional en la editorial Fantagraphics Books como escritor y editor en la revista Amazing Heroes.

[4]​ Su primer trabajo para la editorial Marvel Comics fue como uno de los escritores del crossover Age of Apocalypse en 1995.

[8]​ En 1995 Ralph Macchio y Mark Gruenwald, editores de Marvel, lo contrataron como escritor del título Captain America en conjunto con el artista Ron Garney.

[22]​ Esta decisión causó una reacción negativa tan fuerte entre los fanes que Waid y Wieringo regresaron a Fantastic Four en septiembre de 2003.

[5]​[7]​ En 2005, Waid firmó un contrato exclusivo con duración de dos años con DC Comics, durante el que coescribió la serie limitada 52, junto con Grant Morrison, Geoff Johns, Greg Rucka y Keith Giffen, además de escribir el relanzamiento de The Brave and the Bold con George Pérez y un periodo breve en The Flash.

(2014);[36]​ un segundo periodo en Daredevil (2014);[37]​ Hulk (2014);[38]​ All-New, All-Different Avengers (2015); Champions, una serie sobre un equipo de superhéroes jóvenes (2016);[39]​ Black Widow (2016);[40]​ The Avengers (2016);[41]​ Doctor Strange (2018);[42]​ la serie limitada Ant-Man & the Wasp (2018);[43]​ e Invisible Woman(2019).

[45]​[46]​[47]​ En 2011 Waid estableció el sitio web Thrillbent, dedicado a publicar historietas digitales gratuitas.

Waid colaboró con el artista Gabriel Rodríguez, creando personajes completamente nuevos para esta antología.

Más tarde ese mismo año escribió para esa editorial las series limitadas Superman: The Last Days of Lex Luthor, ilustrada por Bryan Hitch, y World's Finest: Teen Titans, con dibujos de Emanuela Lupaccihno.

[58]​[59]​ Waid negó las acusaciones e inició una campaña en la plataforma de micromecenazgo GoFundMe para financiar los procedimientos legales, en la que contribuyeron los historietistas Neil Gaiman, Kurt Busiek, Dan Slott y Yanick Paquette.

El artista Ethan Van Sciver inició una campaña similar para apoyar a Meyer, que rápidamente superó el monto recaudado por Waid.