La carrera de Marion Isbert comenzó como delantera en el TuS Ahrbach, con el que llegó a la final del campeonato alemán en 1989 y fue máxima goleadora.
[1] Un año después, ella y su equipo no lograron clasificarse para la nueva Bundesliga Femenina.
Luego fichó por Jutta Nardenbach en el TSV Siegen, con el que fue campeona de Alemania en 1991 y 1992, también llegando a la final de la Copa DFB en ambas temporadas, perdiendo en la final ante el Grün-Weiß Brauweiler y el FSV Frankfurt.
Después de la temporada perdió su lugar en el once titular ante Silke Rottenberg.
[6][7] Luego renunció a la selección nacional por motivos familiares.