Después de eso ejerció como profesor titular en la institución.
[1] Fue electo en 2008, después de que Léster Rodríguez, el rector saliente se lanzara a la alcaldía del municipio Libertador.
En 2012 la Comisión Electoral de la Universidad de Los Andes hizo el llamado a elecciones, como correspondía según la Ley de Universidades y el proceso fue paralizado por la Sala Electoral del Tribunal Supremo de Justicia, la cual además ordenó a las autoridades a permanecer en sus cargos, entre ellos Mario Bonucci.
[2] Debido a esto y a la desconfianza de este en el sistema electoral, lleva más de diez años en el cargo después de haber completado el período para el cual fue electo.
[3] En 2023 declaró que el gobierno de Nicolás Maduro «amplía la centralización en el sector universitario para controlarlo y restar autonomía» a la universidad.