Basándose en su experiencia en la SAS, fue él quien propuso la creación de la unidad “FOX” para participar en operaciones secretas.
Después de Metal Gear Solid 3: Snake Eater, dejaría la unidad "FOX" para hacerse del bando rival.
Su nombre fue una vez más limpiado por Naked Snake (ahora conocido como Big Boss).
Esta nueva organización secreta quería gobernar el mundo desde detrás de las escenas, uniéndolo una vez más.
Metal Gear Solid 4: Guns of The Patriots Al final del juego Zero aparece como un hombre ya muy viejo de 105 años en estado vegetal junto a la silla de ruedas que lo transporta, Big Boss explica que a pesar de todo, no siente odio hacia su viejo amigo, sólo siente pena y añoranza y se pregunta si Zero hizo todo aquello porque lo odiaba o le temía.