En ese momento, esta Iglesia tenía creyentes y una organización a ambos lados de la frontera bizantino-persa.
Durante este período se sabía que los persas esclavizaron gran parte del territorio romano que conquistaron y regresaron con una multitud de cautivos, incluidos bizantinos, la sede de Tagrit quedó vacante durante cinco años.
También llevó a cabo una fructífera labor misionera entre los árabes y por todo el valle del río Tigris, difundiendo la fe sirio-ortodoxa.
Con el tiempo, las relaciones entre el catolicós y el patriarca siríaco ortodoxo de Antioquía se volvieron cada vez más tensas y, en ocasiones, condujeron a cismas e interferencias en la elección tanto del catolicós como del patriarca.
En 869 se celebró el Concilio de Capharthutha para regular la relación y resolver las diferencias entre las dos posiciones.
Muchos se establecieron en Mosul y pueblos en las llanuras de Nínive, especialmente Bajdida, así como Tur Abdin.
La sede del catolicós inicialmente estaba en Tagrit,[2] lo que había recibido la confirmación del califa en 991, hasta que en 1089 el gobernador musulmán ordenó la destrucción de la catedral principal, la iglesia de San Ahoadamah conocida como la iglesia verde, y se trasladó a Mosul.
Un gobernador musulmán posterior permitió en 1112 la reconstrucción de la catedral y el mafrián regresó a Tagrit.
[3] Tagrit siguió siendo un centro importante de la Iglesia ortodoxa siriana, hasta que en 1258 los cristianos fueron masacrados y pocos escaparon durante la invasión mongola y finalmente la ciudad fue destruida por Tamerlán a finales del siglo XIV.
La dignidad de mafrián pasó a ser puramente titular[2] y conferida a los metropolitanos jacobitas de Jerusalén, que sin embargo, residían junto al patriarca y nombraban un vicario en Tierra Santa.
No está claro qué tipo de jurisdicción ejercía este mafrián.
[12] El mafrianato de Joubeir no fue oficializado por la Santa Sede y un nuevo patriarca católico solo pudo ser elegido en 1783.