Fundado en 2005, compite en la Lietuvos Krepšinio Lyga, la primera competición de su país..
En 2013, Mažeikiai acabó campeón de la NKL, la segunda división del país, logrando el ascenso a la LKL.
Sin embargo el equipo tuvo que permanecer en la NKL porque su pabellón de juego no cumplía los requisitos para jugar en la LKL, repitiendo título título de la NKL al año siguiente.
Debutaron en la LKL en 2014, pero fueron relegados a la NKL al año siguiente después de una temporada desastrosa.
[1] Regresó a la máxima competición en la temporada 2023-24, tras acabar en segunda posición en la NKL.