A finales de 2004 juega cedido con el Junior de Barranquilla donde esta 6 meses proclamándose campeón frente al Atlético Nacional en el Estadio Atanasio Girardot y para el año 2005 regresa al Union donde desciende a segunda división con el 'ciclón bananero'.
Para 2008 recala en territorio opita fichando por el Atlético Huila donde juega hasta finales de 2010 pero sin afianzarse en el puesto dado que el golero Luis Estacio era el titular indiscutible.
Desde 2011 y hasta 2014 se convirtió en figura de la LDU Loja tanto así que fue nacionalizado ecuatoriano.
El portero colombiano nacionalizado ecuatoriano, Luis Fernando Fernández, fue contratado por el Club Sport Emelec y se sumará a la plantilla azul.
Llegó al equipo quiteño a inicios del 2018, disputará la posición con su compatriota Victor Hugo Soto.