[1]​ Tras la Segunda Guerra Mundial, Slotin continuó su investigación en el Laboratorio Nacional de Los Álamos.

[6]​ El autor Robert Jungk afirma en su libro Más brillante que mil soles.

[6]​ Su tesis doctoral, An Investigation into the Intermediate Formation of Unstable Molecules During some Chemical Reactions fue premiada por la universidad.

Poco después, trabajó durante seis meses como investigador especial en Dublín, Irlanda, probando las baterías de níquel-zinc experimentales que se estaban testando para la línea ferroviaria de Harcourt Street, perteneciente a la empresa Great Southern Railways.

[8]​ Al parecer, el sueldo era muy bajo y Slotin tuvo que pedir apoyo económico a su padre en varias ocasiones.

[nota 1]​ En estos años Slotin escribió numerosos artículos sobre radiobiología, por lo que el Gobierno de Estados Unidos consideró que, dada su experiencia con radiaciones, sería conveniente su incorporación al Proyecto Manhattan, destinado a crear la bomba atómica.

[8]​ Slotin trabajó al principio con el futuro premio Nobel Eugene Wigner en la producción de plutonio y después en el Oak Ridge National Laboratory de Oak Ridge, Tennessee.

[13]​ Después de la guerra, Slotin expresó en varias ocasiones su disgusto con el Proyecto Manhattan.

[1]​ En ese momento, los científicos presentes en la sala observaron el «brillo azul» debido a la ionización del aire y una súbita bocanada de calor.

Slotin, que era el más cercano a la reacción, sintió un sabor agrio en su boca y una intensa sensación de quemazón en su mano izquierda.

[4]​ Instintivamente retiró su mano izquierda, levantando la semiesfera de berilio y tirándola al suelo, terminando así la reacción.

[4]​ Los compañeros de Slotin lo llevaron inmediatamente al hospital, pero había sufrido daños irreparables.

[20]​ El 14 de junio de 1946, el editor asociado de Los Alamos Times, Thomas P. Ashlock, escribió un poema titulado «Slotin - A Tribute»: While you were with us, even strangers knew The breadth and lofty stature of your mind Twas only in the crucible of death La versión oficial expuesta tras los hechos afirmaba que Slotin, al retirar rápidamente la semiesfera superior, actuó como un héroe, finalizando la reacción crítica y protegiendo a las otras siete personas presentes: Sin embargo, Robert B. Brode, uno de los físicos que trabajaban en el proyecto, afirmó que el accidente pudo ser evitado y que Slotin no estaba siguiendo el procedimiento adecuado, poniendo en grave peligro tanto a sus compañeros como a sí mismo.

[4]​ En 1948, los colegas de Slotin en Los Álamos crearon el Louis A. Slotin Memorial Fund por avances en física, otorgado por distinguidos científicos como Robert Oppenheimer y los premio Nobel Luis Walter Álvarez y Hans Bethe.

[22]​[23]​ Como parte del Proyecto Manhattan, tanto el accidente como sus consecuencias fueron dramatizadas en la película de 1989 Creadores de sombras, donde el actor John Cusack encarna a Michael Merriman, un personaje ficticio basado en Slotin.